Les acides aminés réagissant avec le réactif de réaction ninhydrine sont détectés à l'aide de deux longueurs d'onde, à savoir 570 nm et 440 nm.
L'acide aminé primaire (acide α-aminé) est coloré en violet à 570 nm, tandis que l'acide aminé secondaire (acide imino) est coloré en jaune à 440 nm.